深 圳 市 东 创 实 验 科 技 有 限 公 司
全站搜索
东创实验科研服务
在线客服
 工作时间
周一至周五 :9:00-9:00
周六至周日 :9:00-18:00
 联系方式
客服热线:0755-21050468
手机:15818505043
邮箱:specbiolabs@sina.com
设为首页 | 收藏本站

传说中的细胞交叉污染名录?!

发表时间:2022-10-25 10:00作者:Spec东小创

近年来,随着大家对细胞交叉污染现象的重视,很多权威机构和研究单位对目前流通的大量细胞进行了STR鉴定分析,存在交叉污染及错误鉴定的现象非常普遍。给生命科学研究的结果带来了很多的不确定性,甚至已有多篇重要研究成果因此而被期刊撤稿。

而据我们的了解,目前还有不少学者仍在使用身份不明确的细胞开展实验,为提醒大家避免使用错误细胞进行研究,我们整理了国内外多个权威研究机构公布的细胞交叉污染情况,即之前好多客户咨询我们的传说中的“细胞交叉污染名录”,供大家参考:


我们先看看国内细胞库的情况:

库-1.jpg

国家实验细胞资源共享服务平台STR检测中国科学院细胞资源中心保藏的细胞时发现SGC7901、SMMC7721、QGY7701、QGY7703、QSG7701、Ho-8910PM、Ho-8910、BEL7402等多株细胞为同一遗传背景,怀疑彼此间存在交叉污染;而BGC-823确定被HeLa污染。目前这9株细胞在中科院细胞库已经停售,建议大家后续尽量避免使用这几株细胞开展实验。http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=236


另外,武汉大学生命科学学院病毒学国家重点实验室联合中国类型文化收藏中心采用STR细胞鉴定技术对来自国内28个研究所的278株细胞系进行了鉴定分析。发现有来自22个研究所的128株(84种)细胞存在交叉污染或者错误识别,污染/错误识别率达到46%,也就是说每两株细胞可能就有一株存在问题,如果使用这些细胞开展了实验甚至实验结果已经发表那是一件非常可怕的事情。并且有超过20种细胞系在不同研究单位出现相同的污染或误判,说明这些被误认的细胞有在不同研究单位之间流通。所以在使用未明确身份的细胞前最好做一个STR鉴定。

doi: 10.1371/journal.pone.0170384.


表1.84细胞名录

293 A

HCCLM3

293T

HCT-116

293T-6E

HeLa

A2058

HeLa/DDP

A-431

Hep2

A533

HepG2

ACC-2

HIBEC

ACC-M

HIBEPIC

ACHN

HL-7702

AGS

HT-29

BC-019

HUCCA

BC-021

HUCCT1

BC-023

Huh-28

BC-024

Jurcat

BC-025

K324

BC-026

KI-H6

BC-034

LM3

BEL-7402

LNCaP

BEL-7404

LO-2

BEL-7704

LOVO

BGC-823

LX-2

C201441

MCF-7

C2015193

MDA-MB-231

C-33A

MGC-803

Caco-2

MHCC-97H

CCC-HIE2

MHK-28

CCLP-1

MKN-28

CFPAC-1

MKN-45

CHMAS

QBC-939

CNE-2

SGC-7901

Colo320

SK-SY5Y

EJ

SMMC-7721

END3

SW1116

FHC

SW1990

FRH0201

SW480

FSH-74int

THC-8307

GES-1

TREX-293

GIST-T1

TSCCA

GS-hepG2

U-251

H446

U-266

HBE

YTLMC-90

HBL-100

ZOSM

备注:这里并没有说其他单位存在的这些细胞一定都有问题,建议手上有这些细胞的话进行STR鉴定一下,以鉴定结果为主。




我们再看看国外细胞库的情况:

库-2.jpg

国际上,国际细胞系鉴定委员会(ICLAC)最新公布的交叉污染/错误鉴定细胞系名录Database of Cross-Contaminated or Misidentified Cell Lines-v9_0。截至2018年10月ICLAC总共列出了488个被交叉污染/错误鉴定的细胞系。其中451个被错误认定的细胞系目前找不到最初正确的细胞系库存。另37个被错误认定的细胞系,目前有找到正确的细胞系库存。若您目前培养的细胞属于这451个错误认定的细胞,请尽快进行细胞STR鉴定,因为这些细胞被交叉污染或错误识别的概率极大。

https://iclac.org/databases/cross-contaminations/


Table2.Misidentified cell lines where no authentic stock is known.

1-1ras1000 (BALB/3T3 A31-1-1

derivative)

HuL-1

1-1src (BALB/3T3 A31-1-1

derivative)

Hut

1E8 (BLIN-1 derivative)

IMC-2

2008/C13*5.25 (C13, OV2008/C13)

IMC-3

222

IMC-4

2474/90

Intestine 407 (Int-407, HEI)

2563 (MAC-21)

IPDDC-A2

28SC-ES (SC


derivative)

IPRB

2957/90

IPRI-OL-7

3051/80

IPRI-OL-11

3AB-OS (MG-63derivative)

IPTP/98

41M

IST-1

A172TR3 (U251- TR3)

J-111

ACC2

J96

ACC3

JCA-1

ACCM

JHC

ACCNS

JHT (JHCderivative)

ACCS

JHU012

ADLC-5M2

JHU013 (JHU012derivative)

Aedes aegypti , Suitor's clone

JHU019

Aedes vexans


culture

JHU028

AG-F

JMAR (Tu-167derivative)

AKI

JOSK-I

ALVA-31

JOSK-K

ALVA-41

JOSK-M

ALVA-55

JOSK-S

ALVA-101

JROECL 47 (OE47)

AO

JROECL 50 (OE50)

Ao38 (BTI-Tnao38)

JTC-17

ARO81-1 (ARO)

JTC-3

AV3

K051

AZ521

K1

B2-17

K2

BALB/3T3 A31-1-1 (1-1, A31-1-1,Balb/c 3T3 A31-I- 1; BALB/3T3 A31derivative)

KAK1

BALB/3T3 A31-1-13(Balb/c 3T3 A31- 1-13; BALB/3T3 A31 derivative)

KAT10

BCC1/KMC

KAT4

BE-13

KAT5

BEL-7402

KAT50

BEL-7404

KAT7

Bhas42 (BALB/3T3 A31-1-1derivative)

KB

BHP 10-3

KB-3-1 (KB derivative)

BHP 14-9

KB-V1 (KB derivative)

BHP 15-3

KCI-MOH1

BHP 17-10

KM20

BHP 2-7

KM20L2 (KM20 derivative)

BHP 5-16

KM-3

BHP 7-13

KM3

BIC-1

KMS-21-BM

BLIN-1

KMT-2

BM-1604

KNS-89

BrCA 5

KOSC-3

BSCC-93

KP-1N

BT-B

KPB-M15

C16 (MRC-5 derivative)

KPL-1

C-433

KP-P1

CAC2

KSY-1

CaMa (clone 15)

KU7

CaOV

KU-YS

Caov-2

L-132

CaVe

L-41 (J96 derivative)

CCL3

LC5 (L-132 derivative)

CGTH-W-1

LC5-HIV (L-132 derivative)

CH1

LED-Ti

CH1-cisR (CH1 derivative)

LLC-15MB

Chang liver

LN-319

CHB

LN-443

CHP-234

LR10.6

Clom 15

LT-1

Clone 1-5c-4

LU

Clone-16

LU 106

Clone 1A

Lu-130

CMP

M10T

CMPII C2

M4A4 (MDA-MB-435derivative)

CNDT2

M4A4 GFP (MDA-MB-435 derivative)

CNE-1

M4A4 LM3-2 GFP (MDA-MB-435 derivative)

CNE-2

M4A4 LM3-4 CL16 GFP (MDA-MB-435 derivative)

CO (COLE)

MA-1

COLO-38

MA-104

COLO-587

MA-111

COLO-677

MA-160

COLO-775

Mash-1

COLO-818

MaTu

CoLo-TC

MC-4000

Culiseta inornata

McCoy

D18T

MCF-7/AdrR (NCI/ADR-RES)

D-54 MG

MDA-MB-435

D98/AH

MDA-MB-435S (MDA- MB-435 derivative)

D98/AH2 Clone B

MDA-N (MDA-MB-435 derivative)

DAMI

MDS

DAPT

MEL-HO

DD

MEL-WEI

Det30A

MGH-U1 (EJ)

Detroit-6 (Det6)

MGH-U2 (HM)

Detroit-98

MHH-225

Detroit 98/AG

Minnesota EE

Detroit 98/AH-2

MKB-1

Detroit 98/AH-R

MKN28

Detroit 98s

MOBS-1

DM12 (Tu-167 derivative)

MOLT-15

DM14 (Tu-167 derivative)

MPanc-96

DRO90-1 (DRO)

MRO87-1

DuPro-1

MS (Monkey Stable)

EB33

MT-1 [Multiple cell lines with same name, see Cellosaurus]

ECC-1

MT-3 [Multiple cell lines with same name, see Cellosaurus]

ECTC

MUM2C

ECV-304

MUTZ-1

ED27

MV522

EEK

NC-37

EH

NCC16

EJ-1

NCI-H1264

Ej138

NCI-H1304

EL 1

NCI-H1514

ElCo

NCI-H157

EPC

NCI-H1622

EPLC3-2M1

NCI-H1870

EPLC-65

NCI-H249

ESP1

NCI-H513

ETK-1

NCI-H592

EU-1

NCI-H60

EU-7

NCI-H630

EUE

NCI-H738

EVLC2

NCOL-1

F2-4E5

NCTC 2544

F2-5B6

NCTC 3075

F255A4

ND-1

FB2

NM2C5 (MDA-MB-435 derivative)

Fitz-HSA

NM2C5 GFP (MDA- MB-435derivative)

FL

NOI-90

Flow 13000

NOSE06

Flow 5000

NOSE07

Flow 6000

NPA'87

Flow 7000

NS-3

FQ

OCM-1

G-11 (HBT-3 derivative)

OCM-3

GHE

OCM-8

Girardi heart

OCUM-6

GM1312

OE

GOS-3

OF

GPS-M

OLGA-PH-J/92 (OL- J/92)

GPS-PD

ONCO-DG-1

GREF-X

OS 187

GR-M

OST

GT3TKB

OU-AML-1

H-494

OU-AML-2

H7D7A

OU-AML-3

H7D7B

OU-AML-4

H7D7BD5 (H7D7B derivative)

OU-AML-5

H7D7C

OU-AML-6

H7D7D

OU-AML-7

HAC15

OU-AML-8

HAG

OV2008 (A2008)

HBC

Ovary1847

HBL-100

OVMIU

HBT-3

P1-1A3

HBT-39b

P1-4D6

HBT-E (HBT-3 clone)

P39/TSUGANE (P39/TSU)

HCC60

Panc 01.28

HCE

Panc 06.03

HCu-10

PBEI

HCu-18

PC-93

HCu-22

PC-MDS

HCu-27

PCI-22A

HCu-33

PCI-22B

HCu-37

PCI-3

HCu-39

PEAZ-1

HCV-29Tmv (HCV-29 derivative)

PH [Multiple cell lines with same name, see Cellosaurus]

HEC-155

PH61-N

HEC-180

PLB-985

HEK

PPC-1

HEK/HRV (HEK derivative)

PSV811

HEL-R66

QGY-7701

HEp-2 (H.Ep.-2)

QGY-7703

Hep-2C

QSG-7701

Hep2 (Clone 2B)

RAMAK-1

HES

RB

HIMEG-1

RBHF-1

HKB-1

RC-2A

HKMUS

RED-3

HKMUS-SF

REH-6

HL111783

REPC

HMV-1

RERF-LC-MA

HPB-MLT

RERF-LC-OK

HPC-36M (HPC-36 derivative)

RGC-5

hPTC

RM-10

Hs 677.St

RMUG-L

HSC-41

RO-D81-1

HSG

RO-H85-1

HSG-AZA1

RPMI-4788

HSG-AZA3

RPMI-6666

HSGc-C5

RPTC-1

HS-SULTAN

RS-1

HSY

RTSG

hTERT-EEC

RY

Hu1734

SA4

Hu456

SAM-1

Hu549

SAML-1

Hu609

SBC-2

Hu609Tmv (Hu609 derivative)

SBC-7

Hu961a, Hu961t (Hu961 derivatives)

SC (28SC)

HuKo39

SCCTF

SCLC-16H

TE-13

SCLC-24H

TE-2

SEG-1

TE-3

SF767

TE671

SH-2

TE671 Subline No.2

SH-3

TE-7

SJPL

TEC61

SK-GT-5

TI-1

SK-MG-1

TK-1

SK-N-MC

TMH-1

SK-OV-4

TMM

SK-OV-6

TSU-Pr1

SKW-3

Tu-138

SLK

Tu-158LN

SMMC-7721

Tu-159

SNB-19

Tu-167

SNU-1958

Tu-182

SPI-801

Tu-212

SPI-802

Tu-212LN

SpR

TuWi

SQ-5

U-118 MG

SR-91

UCDK9B1

SU-DHL-7

UCDK9B2

SU-DHL-9

UCDK9B3

SW-527

UCDK9B4

SW-598

UCDK9B5

SW-608

UM-UC-2

SW-613

UM-UC-3-GFP (UM-UC-3 derivative)

SW-732

UPES/C

SW-733

UPHHJA

T-1

UTMB-460

T1

VC312R

T-33

WiDr

T404

WISH

T406[Multiple cell lines with same name, see Cellosaurus]

Wong-Kilbourne derivative (WKD)

T409

WRL 68

T-9 (WI-38


derivative)

WSU-ALCL

TCO-1

WSU-CLL

TDL-1

YAA

TDL-2

YAP

TDL-3

YJ

TDL-4

YMB-1

TE-12

YMB-1-E

备注:这些也不是真正的黑名单,只是说明这些细胞污染的可能性非常高,毕竟ICLAC目前仍未找到相应正确STR信息的细胞株。




小鼠源细胞系也有身份认证啦:

库-3.jpg

介于人源细胞系的污染情况,权威机构也陆续公布了小鼠细胞系的STR信息,目前有45个小鼠细胞系具有可供参考的STR信息,我们近期也推出了小鼠STR鉴定服务(国内首推),目前可鉴定的小鼠细胞目录见下表:


表3.可STR鉴定的45个小鼠细胞系名录。

2E8

M-1

3T3-Swiss albino

mIMCD-3

4T1

MLTC-1

A20

M-NFS-60

A9

MS1(Mile Sven 1)

B16-F1

NCTC clone 929(L-929)

B16-FO

NMuMG

BALB/3T3 clone A31

NTH/3T3

BCL1 clone 5B1b

P19

CMT-93

P3X63Ag8.653

CT26.CL25

P815

CT26.WT

RAW 264.7

CTLL-2

RAW 264.7 gamma NO(-)

D10.G4.1

Renca

EMT6

Sp2/0-Ag14

EOC 20

STO

Hepa 1-6

W-20-17

Hepa-1c1c7

WEHI 164

J558

WEHI-13VAR

JC

WEHI-3

L1210

YAC-1

LL/2(LLC1)



如果您正好想鉴定手上的小鼠细胞,正好也在这45个细胞内,那就赶紧联系我们吧。




深圳东创实验代理赛库生物的STR鉴定服务,如需了解更多信息,请联系我们 ~